滨市立大学附属机构包括有木原生物学研究所、大学医院、图书馆、学术信息中心、医学信息中心。学校在研究方面采用了21世纪COE教学大纲，医学系以细胞急性系统研究为基础所进行的未来医疗创成研究，入选了日本教育部资金扶持计划。横滨市立大学是日本一所小规模精英大学，以招生数量少、入学严格著称，历届毕业生在日本各界均得到了极高的评价。
横滨市立大学硕士课程设置
城市规划、都市、环境政策、社会文化、地域社会、社会经济、海外地域、国际关系、人间科学、语言文化、临床教育、教育学、心理学、日语、英语、社会、数学、理科、技术、家政、音乐、美术、保健体育、经济学、社会文化论等。
学科设置
金泽八景校区(旧称：濑户校区)(横滨市金泽区濑户)国际总合科学部福浦校区(横滨市金泽区福浦)医学部鹤见校区(横滨市鹤见区)大学院国际总合科学研究科生体超分子科学专攻舞冈校区(横滨市户冢区舞冈町)木原生物学研究所
部国际总合科学科、国际教养学系、人间科学组、国际文化创造组、理学系、基盘科学组、环境生命组、经营科学系、政策经营组、国际经营组、融合领域、起业战略组、医学部、医学科、看护学科
